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苏州医学院基础医学院源自苏州医学院基础医学系。2008年初基础医学系和生命科学学院合并组建苏州大学基础医学与生物科学学院。2023年12月，因学科建设发展需要，成立苏州医学院基础医学院。
学院拥有基础医学一级学科博士点和博士后流动站，是江苏省高校优势学科建设单位。近年来，与学院相关的生物与生物化学、神经生物学与行为学、分子生物学与遗传学、免疫学、微生物学5个学科方向陆续进入ESI全球前1%；基础医学学科在2022年全国第五轮学科评估中保持前列，在省优势学科第三期建设评估中获评“优秀”。
学院拥有基础医学一级学科博士点和博士后流动站，是江苏省高校优势学科建设单位。近年来，与学院相关的生物与生物化学、神经生物学与行为学、分子生物学与遗传学、免疫学、微生物学5个学科方向陆续进入ESI全球前1%；基础医学学科在2022年全国第五轮学科评估中保持前列，在省优势学科第三期建设评估中获评“优秀”。
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